COVID-19 ウイルス学
コロナウイルス
コロナウイルス科のオルトコロナウイルス亜科に属します。
エンベロープを持つRNAウイルスであり、約26～32 kb（キロベース）の一本鎖プラス鎖RNAゲノムを有します。
トリ、ラクダ、コウモリ、ハクビシン、マウス、イヌ、ネコ及びヒトを含む広範な哺乳類で宿主として確認されています。
- 2種類のヒトコロナウイルス（HCoV-229E、HCoV-OC43）は一般に軽い疾患（通常は風邪）の原因です。
- 3種類の動物原生コロナウイルス（SARS-CoV、MERS-CoV、SARS-CoV-2）は重度の呼吸器感染症を引き起こします。
SARS-CoV-2はコロナウイルス科に属するエンベロープを持つRNAウイルスであり、SARS-CoV及びMERS-CoVと類似しています。
- Coronaviridae Study Group of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Nat Microbiol. 2020 Mar 2. doi: 10.1038/s41564-020-0695-z. [Epub ahead of print].
- Lu R, et al. Lancet. 2020 Feb 22;395(10224):565-574. doi: 10.1016/S0140-6736(20)30251-8. Epub 2020 Jan 30.
- Graham et al, Nature Reviews Microbiology 2013
3種類の動物原生コロナウイルスの命名とその流行経緯
SARS-CoV-2は過去20年間に動物からヒトに感染したことがわかっている3番目のコロナウイルスであり、大規模なエピデミック（局地的流行）をもたらしました。
*致死率は1～3%であるが、感染は拡大中であり、追加調査が必要です。
- Gorbalenya et al. Nat Microbiol. 2020 Mar 2. doi: 10.1038/s41564-020-0695-z. [Epub ahead of print].
- Lu R, et al. Lancet. 2020 Feb 22;395(10224):565-574. doi: 10.1016/S0140-6736(20)30251-8. Epub 2020 Jan 30.
- Scripps Research Institute March 17, 2020 https://www.sciencedaily.com/releases/2020/03/200317175442.htm
- Li et al, NEJM Jan 2020
- Coburn et al. BMC Medicine 2009
- Mahase BMJ 2020 368:m641 doi: 10.1136/bmj.m641. 4
- Wu et al Jama 2020 Feb 24.
2019 SARS-CoV-2のゲノム特性
SARS-CoV-2は、2種類のコウモリ由来のSARS様コロナウイルスと密接に関連しています（一致率88%）。
SARS-CoV-2は、MERS-CoVと異なります（一致率50%）。
Lu R, et al. Lancet. 2020 Feb 22;395(10224):565-574. doi: 10.1016/S0140-6736(20)30251-8. Epub 2020 Jan 30.
SARS-CoV-2は、ACE2受容体を利用して宿主細胞に侵入する
ACE2（アンジオテンシン変換酵素II ）は、SARS-CoVの細胞受容体であることが知られています1,2。
ACE2を発現している、又は発現していないHeLa細胞を用いて、ウイルス感染性試験が実施されました2。
ACE2を発現している細胞において、SARS-CoV-2は全てのACE2（マウスのACE2を除く）をエントリーレセプターとして使用することができますが、ACE2を発現していない細胞では使用できません2。
https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
h＝ヒト、m＝マウス
青＝核、緑＝ACE2タンパク質、赤＝ウイルスタンパク質。
ACE2はSARS-CoV-2の細胞受容体である可能性が高い。
- Li et al, Nature 2003
- Zhou P, et al. Nature. 2020 Feb 3. doi: 10.1038/s41586-020-2012-7. [Epub ahead of print]
ACE2受容体分布から考察するSARS-CoV-2に対する臓器のリスク
SARS-CoV-2は、ACE2受容体を利用して宿主細胞に侵入します1,2。
SARS-CoV-2は、ヒト細胞受容体であるアンジオテンシン変換酵素II（ACE2）に強い結合親和性を持ちます3。
SARS-CoV-2感染症に対する
各種臓器の脆弱性を示すリスクマップ* 3
Zou X, et al. Front Med. 2020:Mar 12.
https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
ACE2受容体に対するSARS-CoV-2の親和性及びこれらの宿主受容体の分布が、臓器の脆弱性に関与している可能性があります。
*この分析では、2019-nCoVに脆弱な臓器を全て検証したわけではありません。
- Li et al, Nature 2003
- Zhou P, et al. Nature. 2020 Feb 3. doi: 10.1038/s41586-020-2012-7. [Epub ahead of print]
- Zou X, et al. Front Med. 2020:Mar 12. doi: 10.1007/s11684-020-0754-0. [Epub ahead of print]
